1702 yılında İtalya'nın Como kentinde asil bir şekilde doğdu. Avusturya savaşından kaçarak geldiği İspanya'da, Moctezuma'nın soyundan gelenlerin emekli maaşlarını Meksika Kraliyet Cajas'ında toplamak için geniş yetkiler alır.
1736'da Yeni İspanya'ya gitti. Kaldığı sekiz yıl boyunca kendisini Guadalupe Meryem Ana'nın görünüşlerini araştırmaya adadı ve hatırı sayılır grafik ve resimsel malzeme topladı. Genel valilere güvensizliğe neden olan Guadalupan imajının taçlandırılmasını teşvik eder. Esir alınır ve koleksiyonu elden çıkarılır. Aylar sonra, İspanya'ya sınır dışı edildikten sonra, kendisini Cebelitarık'ta terk eden korsanların eline düşen bir gemiye biner.
Harika eserlerle İspanya'ya geldi ve Boturini'nin kendisini yerli halkların tarihi hakkında yazmaya adamak için reddettiği bir pozisyon olan Kızılderililerin Kraliyet Chronicler'ı olarak beraatini elde eden koleksiyoncu Mariano Fernández de Echeverríay Veytia ile temasa geçti. Koleksiyonunu hiçbir zaman kurtaramamasına rağmen üzerine Hint Müzesi Kataloğu yazdı. Çalışmaları çok orijinal ve iyi belgelenmiştir. 1750-1755 yılları arasında belirsiz bir tarihte Madrid'de öldü.
